Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmem109Q3UBX0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem109Q3UBX0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem109Q3UBX0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem109Q3UBX0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms