Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ulk3Q3U3Q1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ulk3Q3U3Q1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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