Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colec11Q3SXB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Colec11Q3SXB8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Colec11Q3SXB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Colec11Q3SXB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Colec11Q3SXB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colec11Q3SXB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colec11Q3SXB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Colec11Q3SXB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Colec11Q3SXB8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms