Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RelaQ04207 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelaQ04207 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelaQ04207 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RelaQ04207 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RelaQ04207 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelaQ04207 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelaQ04207 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms