Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pax8Q00288 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pax8Q00288 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pax8Q00288 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Pax8Q00288 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms