Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SlbpP97440 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SlbpP97440 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SlbpP97440 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlbpP97440 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SlbpP97440 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlbpP97440 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlbpP97440 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlbpP97440 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlbpP97440 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms