Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms