Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp3P57722 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp3P57722 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcbp3P57722 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pcbp3P57722 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcbp3P57722 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcbp3P57722 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcbp3P57722 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pcbp3P57722 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcbp3P57722 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pcbp3P57722 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms