Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GferP56213 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GferP56213 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GferP56213 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GferP56213 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GferP56213 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GferP56213 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GferP56213 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GferP56213 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GferP56213 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GferP56213 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GferP56213 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GferP56213 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GferP56213 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GferP56213 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GferP56213 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GferP56213 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GferP56213 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GferP56213 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GferP56213 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GferP56213 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GferP56213 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GferP56213 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GferP56213 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GferP56213 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GferP56213 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GferP56213 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GferP56213 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GferP56213 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GferP56213 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GferP56213 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GferP56213 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GferP56213 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GferP56213 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GferP56213 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GferP56213 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GferP56213 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GferP56213 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GferP56213 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GferP56213 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GferP56213 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GferP56213 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GferP56213 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GferP56213 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GferP56213 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GferP56213 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GferP56213 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GferP56213 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GferP56213 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GferP56213 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GferP56213 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GferP56213 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GferP56213 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GferP56213 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GferP56213 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GferP56213 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GferP56213 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GferP56213 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GferP56213 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GferP56213 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GferP56213 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GferP56213 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GferP56213 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GferP56213 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GferP56213 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GferP56213 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GferP56213 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GferP56213 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GferP56213 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GferP56213 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GferP56213 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GferP56213 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GferP56213 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GferP56213 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GferP56213 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GferP56213 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GferP56213 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GferP56213 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GferP56213 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GferP56213 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GferP56213 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms