Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sh3bp1P55194 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1P55194 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1P55194 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms