Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cav1P49817 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cav1P49817 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cav1P49817 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cav1P49817 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cav1P49817 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cav1P49817 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cav1P49817 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cav1P49817 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cav1P49817 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cav1P49817 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cav1P49817 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cav1P49817 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cav1P49817 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cav1P49817 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms