Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfx2P48379 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rfx2P48379 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfx2P48379 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfx2P48379 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms