Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHBP21912 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHBP21912 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHBP21912 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHBP21912 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHBP21912 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDHBP21912 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHBP21912 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHBP21912 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHBP21912 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHBP21912 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHBP21912 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHBP21912 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHBP21912 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHBP21912 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHBP21912 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHBP21912 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHBP21912 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHBP21912 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHBP21912 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHBP21912 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHBP21912 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHBP21912 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHBP21912 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHBP21912 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHBP21912 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHBP21912 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHBP21912 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHBP21912 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHBP21912 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHBP21912 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHBP21912 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHBP21912 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHBP21912 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHBP21912 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHBP21912 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHBP21912 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHBP21912 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHBP21912 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHBP21912 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHBP21912 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHBP21912 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHBP21912 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHBP21912 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHBP21912 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHBP21912 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHBP21912 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHBP21912 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHBP21912 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHBP21912 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHBP21912 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHBP21912 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHBP21912 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHBP21912 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHBP21912 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHBP21912 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHBP21912 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHBP21912 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHBP21912 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHBP21912 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHBP21912 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHBP21912 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDHBP21912 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SDHBP21912 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHBP21912 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHBP21912 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHBP21912 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHBP21912 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDHBP21912 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDHBP21912 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHBP21912 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHBP21912 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms