Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RapsnP12672 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RapsnP12672 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RapsnP12672 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RapsnP12672 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RapsnP12672 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RapsnP12672 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RapsnP12672 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RapsnP12672 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RapsnP12672 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RapsnP12672 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RapsnP12672 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms