Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna4P07351 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna4P07351 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna4P07351 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna4P07351 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna4P07351 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna4P07351 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna4P07351 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna4P07351 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna4P07351 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna4P07351 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms