Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa4P06798 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa4P06798 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxa4P06798 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa4P06798 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa4P06798 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms