Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt10P02535 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt10P02535 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt10P02535 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt10P02535 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt10P02535 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt10P02535 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt10P02535 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt10P02535 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt10P02535 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt10P02535 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt10P02535 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt10P02535 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt10P02535 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt10P02535 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt10P02535 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms