Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-K1P01901 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-K1P01901 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-K1P01901 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
H2-K1P01901 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-K1P01901 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms