Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacng2O88602 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacng2O88602 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacng2O88602 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacng2O88602 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms