Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme6O88425 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme6O88425 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme6O88425 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme6O88425 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme6O88425 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme6O88425 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme6O88425 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms