Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xirp1O70373 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xirp1O70373 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xirp1O70373 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xirp1O70373 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xirp1O70373 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms