Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lgals6O54891 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lgals6O54891 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgals6O54891 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lgals6O54891 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms