Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc18a3O35304 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc18a3O35304 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc18a3O35304 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc18a3O35304 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms