Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna2d1O08532 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d1O08532 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d1O08532 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d1O08532 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d1O08532 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms