Protein–RNA interactions for Protein: M0QWW3

Gm3187, Predicted gene 3187 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3187M0QWW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3187M0QWW3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3187M0QWW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3187M0QWW3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3187M0QWW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms