Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm44G3UW88 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm44G3UW88 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm44G3UW88 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm44G3UW88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm44G3UW88 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm44G3UW88 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm44G3UW88 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm44G3UW88 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm44G3UW88 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm44G3UW88 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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