Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3020E9Q3J7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3020E9Q3J7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3020E9Q3J7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3020E9Q3J7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms