Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cspp1B2RX88 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cspp1B2RX88 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cspp1B2RX88 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.1 ms