Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssxb8B1AY40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssxb8B1AY40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb8B1AY40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb8B1AY40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms