Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms