Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28919A0A087WP35 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28919A0A087WP35 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm28919A0A087WP35 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28919A0A087WP35 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28919A0A087WP35 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28919A0A087WP35 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28919A0A087WP35 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms