RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 POLG2Q9UHN1 485 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 LRBAP50851 2863 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 QSOX1O00391 747 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TPBGLP0DKB5 382 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CTNNA2P26232 953 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPN7P35236 360 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NSG1P42857 185 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 GLRBP48167 497 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNG1Q06432 222 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD11Q693B1 232 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PACS1Q6VY07 963 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC13Q8NBP0 860 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 STYXQ8WUJ0 223 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NACC2Q96BF6 587 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC45Q96CN5 670 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NDC1Q9BTX1 674 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TFR2Q9UP52 801 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 AP2A1O95782 977 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 FTH1P02794 183 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TPH1P17752 444 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP11P24347 488 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMA3P25788 255 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA3P26006 1051 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 GCGRP47871 477 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ITIH4Q14624 930 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KIR2DS3Q14952 304 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 BRD3Q15059 726 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ELMO1Q92556 727 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 DLG3Q92796 817 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 FKBP10Q96AY3 582 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 EURLQ9NYK6 297 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GX78 115 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC78A2IDD5 438 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 OR51F1A6NGY5 319 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ISM1B1AKI9 464 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 E2F3O00716 465 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM1AO60341 852 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOX12BO75342 701 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ONECUT2O95948 504 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ALBP02768 609 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGAXP20702 1163 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGP20916 626 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXN2P32314 431 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 ARSFP54793 590 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 POU6F1Q14863 301 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 HIF1AQ16665 826 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 PARP6Q2NL67 630 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SYTL3Q4VX76 610 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNMB4Q86W47 210 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms