RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 NRTNQ99748 197 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 OXSMQ9NWU1 459 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 CPNE7Q9UBL6 633 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 BGNP21810 368 aa22■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 CDKL4Q5MAI5 379 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 SFRP1Q8N474 314 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 PDPRQ8NCN5 879 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 SLC37A2Q8TED4 501 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 PATE1Q8WXA2 126 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 TCEAL3Q969E4 200 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 LIPMQ5VYY2 423 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 SLC25A45Q8N413 288 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 PKP4Q99569 1192 aa21.99■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.98■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 OR6Y1Q8NGX8 325 aa21.98■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 STX16O14662 325 aa21.97■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.97■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.97■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 LNP1A1A4G5 178 aa21.96■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 HERVK_113P63132 956 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTN4-210ENST00000588618 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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ACTN4-210ENST00000588618 ARL10Q8N8L6 244 aa21.96■■□□□ 1.11
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