RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 SOX13Q9UN79 622 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.52□□□□□ -0.08
CTIF-203ENST00000587752 A0A0J9YY10 115 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 E7EQ34 232 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 K7EM74 188 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 ZNF749O43361 778 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 KDM1AO60341 852 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 DNAJB5O75953 348 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TMEM63AO94886 807 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CTSBP07858 339 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 PKLRP30613 574 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 FMO4P31512 558 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 RORAP35398 523 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 KYNUQ16719 465 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 COG1Q8WTW3 980 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TCTN2Q96GX1 697 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 PANX3Q96QZ0 392 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 NFS1Q9Y697 457 aa14.52□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 KRT87PA6NCN2 255 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 NIPSNAP2O75323 286 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 OR2B3O76000 313 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SLCO2B1O94956 709 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 BDKRB1P46663 353 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 RAB28P51157 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CHAF1BQ13112 559 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 GRB7Q14451 532 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 KIR2DS3Q14952 304 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 UGT8Q16880 541 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 C1orf189Q5VU69 101 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SYVN1Q86TM6 617 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 GPR135Q8IZ08 494 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 LRFN5Q96NI6 719 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TLK1Q9UKI8 766 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MED13Q9UHV7 2174 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.51□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 RFPL1O75677 317 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 RPN2P04844 631 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MSL3P1P0C860 447 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MAGP20916 626 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CD9P21926 228 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MAGEA6P43360 314 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 GABRA4P48169 554 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 PMS2P54278 862 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CPZQ66K79 652 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 CNSTQ6PJW8 725 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 LRRC6Q86X45 466 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 LPGAT1Q92604 370 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 BIRC8Q96P09 236 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 MENTQ9BUN1 341 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 SNX7Q9UNH6 387 aa14.5□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTIF-203ENST00000587752 ARGFXA6NJG6 315 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms