RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 WDR54Q9H977 334 aa9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 LRBAP50851 2863 aa9.91□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 A0A1B0GX78 115 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 F8W8V4 182 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CCL22O00626 93 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 PJA2O43164 708 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 HCRTR1O43613 425 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 AP2A1O95782 977 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ALBP02768 609 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 MMP11P24347 488 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ITGA3P26006 1051 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ACADLP28330 430 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CETN2P41208 172 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 MAGEA1P43355 309 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 GLRBP48167 497 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ARSFP54793 590 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ITIH4Q14624 930 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 SLC9A5Q14940 896 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 DBN1Q16643 649 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 SYTL3Q4VX76 610 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 PACS1Q6VY07 963 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CUZD1Q86UP6 607 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 ELMO1Q92556 727 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 KRT35Q92764 455 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 VPS50Q96JG6 964 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-210ENST00000580799 CREBBPQ92793 2442 aa9.9□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 CCDC78A2IDD5 438 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ISM1B1AKI9 464 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 TJP3O95049 919 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ONECUT2O95948 504 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 OR56A5P0C7T3 313 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 TPBGLP0DKB5 382 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 PSMA3P25788 255 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 GCGRP47871 477 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 KCTD11Q693B1 232 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 KCNMB4Q86W47 210 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 STYXQ8WUJ0 223 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 AGAP4Q96P64 663 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 EURLQ9NYK6 297 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 MROH6A6NGR9 719 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 DSCR3O14972 297 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 RPN2P04844 631 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 PRSS56P0CW18 603 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 EDN3P14138 238 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ITGAXP20702 1163 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 MAGP20916 626 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ALAS2P22557 587 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 TNFRSF8P28908 595 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 RAB28P51157 221 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 SPARCL1Q14515 664 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 POU6F1Q14863 301 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 SPA17Q15506 151 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 PARP6Q2NL67 630 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 P3H1Q32P28 736 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-210ENST00000580799 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms