RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ZBTB2Q8N680 514 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 LPGAT1Q92604 370 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CERS2Q96G23 380 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CTRCQ99895 268 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 XKR8Q9H6D3 395 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ZFATQ9P243 1243 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 KNTC1P50748 2209 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PIPSLA2A3N6 862 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TLCD2A6NGC4 264 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 C2orf74A8MZ97 194 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ISM1B1AKI9 464 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 KLK10O43240 276 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 VPS26AO75436 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 HAUS5O94927 633 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ACADLP28330 430 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SHMT2P34897 504 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 RAB15P59190 212 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PPP1CAP62136 330 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 MPP1Q00013 466 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 NFKB2Q00653 900 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SLC7A5Q01650 507 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ANKS6Q68DC2 871 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 DUPD1Q68J44 220 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 XKR5Q6UX68 686 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 VRK3Q8IV63 474 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 UBXN4Q92575 508 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 BIRC8Q96P09 236 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 OR6C1Q96RD1 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CD180Q99467 661 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 MAP3K3Q99759 626 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 RAB33BQ9H082 229 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PDP2Q9P2J9 529 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.55□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 B4E171 279 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 BTN3A3O00478 584 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 BTN3A1O00481 513 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SUV39H1O43463 412 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 GPC4O75487 556 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SLCO2B1O94956 709 aa7.54□□□□□ -1.2
SMG6-211ENST00000572369 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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