RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564841.1

LINC00554-201, long intergenic non-protein coding RNA 554, humanhuman

BASIC

Gene LINC00554, Length 3,011 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00554-201ENST00000564841 MTSS1O43312 755 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 DNAJB5O75953 348 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 FGF4P08620 206 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CD1DP15813 335 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CDONQ4KMG0 1287 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 GALNT10Q86SR1 603 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PGBD5Q8N414 524 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 OR2T12Q8NG77 320 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SNAPC3Q92966 411 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CAPNS2Q96L46 248 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PHOX2BQ99453 314 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 GJB3O75712 270 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 IGFBP5P24593 272 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 DAB2P98082 770 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CARD16Q5EG05 197 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SYVN1Q86TM6 617 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 GALPQ9UBC7 116 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 A0A1W2PQ72 361 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 G6PDP11413 515 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 RYKP34925 604 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 EID3Q8N140 333 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 RNF170Q96K19 258 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SCN3BQ9NY72 215 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 RNF6Q9Y252 685 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 AKR7A2O43488 359 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CYP2A7P20853 494 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 OR3A3P47888 321 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 NLRP8Q86W28 1048 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PIK3R3Q92569 461 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 RGS18Q9NS28 235 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 ARHGAP33O14559 1287 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PIRTP0C851 137 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 DAPP51397 102 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 FXNQ16595 210 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TAC4Q86UU9 113 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CCDC120Q96HB5 630 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 B3GALT6Q96L58 329 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 KLHL5Q96PQ7 755 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 MUTYHQ9UIF7 546 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 VPS4AQ9UN37 437 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 EVPLLA8MZ36 301 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SLC16A6O15403 523 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 HLA-DQB2P05538 268 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 HSMCR30P0CW71 290 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 WEE1P30291 646 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SLC15A1P46059 708 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 RFX2P48378 723 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 DAOAP59103 153 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CREMQ03060 361 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SEMA3BQ13214 749 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 COQ5Q5HYK3 327 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 C6orf136Q5SQH8 315 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 GTF2H4Q92759 462 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 DPF3Q92784 378 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 DNASE1L2Q92874 299 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 ACTL8Q9H568 366 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 USE1Q9NZ43 259 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 TLL1O43897 1013 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 C1QCP02747 245 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 HTR6P50406 440 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00554-201ENST00000564841 NUDT6P53370 316 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms