RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.49■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASGRF2O14827 1237 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPAG6O75602 509 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCG1P45844 678 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARL4DP49703 201 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRB7Q14451 532 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKS6Q68DC2 871 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPATCH11Q8N954 259 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNE4Q8WWG9 221 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSAT1Q9Y617 370 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CATP04040 527 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGS4P49798 205 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDKN2DP55273 166 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSD11B2P80365 405 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIR2DS3Q14952 304 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPESP1Q6UW49 350 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PMEPA1Q969W9 287 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BTRCQ9Y297 605 aa21.47■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UGT2B7P16662 529 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FDXRP22570 491 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MCM3P25205 808 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPX6P59796 221 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SH3BP2P78314 561 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXM1Q08050 763 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL11RAQ14626 422 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 D2HGDHQ8N465 521 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPM1MQ96MI6 270 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR6C1Q96RD1 312 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPH1Q9BZG8 443 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHOJQ9H4E5 214 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APMAPQ9HDC9 416 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VWA7Q9Y334 891 aa21.46■■□□□ 1.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM159BA6NKW6 160 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIPCP11150 499 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STX2P32856 288 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACY1Q03154 408 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL17FQ96PD4 163 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR2A14Q96R47 310 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMO2Q99518 471 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTRCQ99895 268 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.45■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ISM1B1AKI9 464 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STMND1H3BQB6 276 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO1CO00159 1063 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K7O43318 606 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ST6GAL1P15907 406 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBB3Q13509 450 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RELL1Q8IUW5 271 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR9A1PQ8NGU1 263 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASB11Q8WXH4 323 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFT81Q8WYA0 676 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms