RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM135	Q86UB9	458 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTN2	Q96GX1	697 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF12	Q99081	682 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM117A	Q9C073	453 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	CES2	O00748	559 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K7	O43318	606 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	HCRTR1	O43613	425 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM1A	O60341	852 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	RPN2	P04844	631 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN4	P29074	926 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	NFKB2	Q00653	900 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DS3	Q14952	304 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED2	Q15363	201 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	MR1	Q95460	341 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB12	Q96P63	405 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST8	Q9H2A9	424 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX12	Q9UMY4	172 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	NBAS	A2RRP1	2371 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YY10	115 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEB16	A2A368	324 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QKU1	62 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	KPNA5	O15131	536 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF2	O75151	1096 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN1	P07384	714 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CD9	P21926	228 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FNTA	P49354	379 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGA1	P56199	1179 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPU	Q71F23	418 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	21.01	■□□□□ 0.95	3e-7	■■■□□ 15.2
PPP4C-205	ENST00000563200	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	POLH	Q9Y253	713 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	MED13	Q9UHV7	2174 aa		21.01	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC14C	A4D256	554 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF185	O15231	689 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	SUV39H1	O43463	412 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC28A2	O43868	658 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2A7	P20853	494 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	GBX1	Q14549	363 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT8	Q16880	541 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	HOOK3	Q86VS8	718 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC14L1	Q92503	715 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	NFS1	Q9Y697	457 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RELN	P78509	3460 aa		21	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FLNC	Q14315	2725 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ISM1	B1AKI9	464 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200		E7EQ34	232 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF749	O43361	778 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF5C	O60282	957 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPSNAP2	O75323	286 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ESR1	P03372	595 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	FMO4	P31512	558 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	IL10RA	Q13651	578 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	NEPRO	Q6NW34	567 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CASC4	Q6P4E1	433 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	SYVN1	Q86TM6	617 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17F	Q96PD4	163 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		20.99	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	RASGRF2	O14827	1237 aa		20.98	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf105	O95561	183 aa		20.98	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	S1PR4	O95977	384 aa		20.98	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSB	P07858	339 aa		20.98	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PAM	P19021	973 aa		20.98	■□□□□ 0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95

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