RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553361.5

XRCC3-204, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-204ENST00000553361 NUDT9Q9BW91 350 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CASS4Q9NQ75 786 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 VPS4AQ9UN37 437 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 KDM1AO60341 852 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CEACAM4O75871 244 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 UQCRFS1P47985 274 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GABRA4P48169 554 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 MED25Q71SY5 747 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RAB43Q86YS6 212 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GLIS1Q8NBF1 620 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SGSM3Q96HU1 749 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 LUZP4Q9P127 313 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SEC16AO15027 2179 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 H3BMH7 237 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 ALAS2P22557 587 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GNLYP22749 145 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RAB28P51157 221 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RRADP55042 308 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 ACVR1Q04771 509 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SSPNQ14714 243 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SLC9A5Q14940 896 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 KIR2DS3Q14952 304 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RPS6KA1Q15418 735 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 KYNUQ16719 465 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 KRT222Q8N1A0 295 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 IL17FQ96PD4 163 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GBP5Q96PP8 586 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CARD6Q9BX69 1037 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GPR83Q9NYM4 423 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PAK5Q9P286 719 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CDYLQ9Y232 598 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.93■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 DPM1O60762 260 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 GPC4O75487 556 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 APOA4P06727 396 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 MAGP20916 626 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PKLRP30613 574 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 FOXL2P58012 376 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CRADDP78560 199 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PCID2Q5JVF3 399 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 NDC1Q9BTX1 674 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 EURLQ9NYK6 297 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 MAP10Q9P2G4 905 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.92■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 BLACEA4D250 179 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PEX12O00623 359 aa15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
XRCC3-204ENST00000553361 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms