RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552268.5

APAF1-211, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1-211ENST00000552268 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 RAB23Q9ULC3 237 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SUFUQ9UMX1 484 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 GPR34Q9UPC5 381 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.46□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 MYLKQ15746 1914 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 PRSS38A1L453 326 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 A6NCN8 305 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 GRID2O43424 1007 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 PCDHGA12O60330 932 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 CDK14O94921 469 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 HAUS5O94927 633 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 AHSGP02765 367 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 GSTA2P09210 222 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 GPR89BP0CG08 455 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 ZNF883P0CG24 379 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 CD59P13987 128 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 KELP23276 732 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 DGKAP23743 735 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 HTR1BP28222 390 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SLC1A2P43004 574 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 LIMS1P48059 325 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SEPHS1P49903 392 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 C21orf59P57076 290 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 PRAMEP78395 509 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 PPARDQ03181 441 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 VMACQ2NL98 169 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 DOK6Q6PKX4 331 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 PACS1Q6VY07 963 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 SKA1Q96BD8 255 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 ULK4Q96C45 1275 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 CFAP36Q96G28 342 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 FMO2Q99518 471 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 LRRC61Q9BV99 259 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 GAREM1Q9H706 876 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 RMI1Q9H9A7 625 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 GALPQ9UBC7 116 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 KLQ9UEF7 1012 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.45□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.45□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.44□□□□□ -1.38
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APAF1-211ENST00000552268 TRIM38O00635 465 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 YY2O15391 372 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 DFNA5O60443 496 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 SDC3O75056 442 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 AP2A2O94973 939 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 RASGRP1O95267 797 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 ASMTLO95671 621 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 EML2O95834 649 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 TNFP01375 233 aa6.44□□□□□ -1.38
APAF1-211ENST00000552268 GLI4P10075 376 aa6.44□□□□□ -1.38
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