RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222		E7ESA3	106 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	BANF1	O75531	89 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UBXN7	O94888	489 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	EBLN1	P0CF75	366 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	AMD1	P17707	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ITGAL	P20701	1170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GLRB	P48167	497 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PLTP	P55058	493 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CACNG1	Q06432	222 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	IL11RA	Q14626	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MR1	Q95460	341 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ASB8	Q9H765	288 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	VPS18	Q9P253	973 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	OR51F1	A6NGY5	319 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	C21orf140	B9A014	251 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	USP1	O94782	785 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	F3	P13726	295 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ARNT	P27540	789 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FOXN2	P32314	431 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC19A1	P41440	591 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	EPHA4	P54764	986 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PRAME	P78395	509 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TUBB3	Q13509	450 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ULK4	Q96C45	1275 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MTOR	P42345	2549 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GTL3	188 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26	2e-6	■■■■□ 21.8
CS-231	ENST00000552222	VEGFD	O43915	354 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MTX2	O75431	263 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	VAPB	O95292	243 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TTC4	O95801	387 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	RECK	O95980	971 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	POLB	P06746	335 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PGAM1	P18669	254 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PAM	P19021	973 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ACRV1	P26436	265 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ELK3	P41970	407 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TESK1	Q15569	626 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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