RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CDKAL1Q5VV42 579 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 KBTBD2Q8IY47 623 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 DTX3LQ8TDB6 740 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 AGAP11Q8TF27 550 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MAGED4Q96JG8 741 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 DMRTA2Q96SC8 542 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 GPAMQ9HCL2 828 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HAUS2Q9NVX0 235 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SMOXQ9NWM0 555 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 EURLQ9NYK6 297 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 RTTNQ86VV8 2226 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 FAM227AF5H4B4 570 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.321e-14■■□□□ 12.5
CS-230ENST00000551968 USP1O94782 785 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 PRAMEF1O95521 474 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ACPPP15309 386 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 FERP16591 822 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 GJC1P36383 396 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HSF1Q00613 529 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 KLC1Q07866 573 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CEBPEQ15744 281 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 FKBP15Q5T1M5 1219 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ATG9BQ674R7 924 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 DNAAF3Q8N9W5 541 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 GPR137Q96N19 417 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CRB3Q9BUF7 120 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 COG4Q9H9E3 785 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 PLCL2Q9UPR0 1127 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SCINQ9Y6U3 715 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 A0A0J9YY10 115 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 DSCR3O14972 297 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ITGAMP11215 1152 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CACNG1Q06432 222 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 TFF3Q07654 80 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 TMEM198Q66K66 360 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SARM1Q6SZW1 724 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 LAPTM4BQ86VI4 370 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HOOK3Q86VS8 718 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 DOLPP1Q86YN1 238 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HM13Q8TCT9 377 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ZNF398Q8TD17 642 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HES7Q9BYE0 225 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CUTCQ9NTM9 273 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 OR5H15A6NDH6 313 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MAP2K7O14733 419 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 SERPINA7P05543 415 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MX2P20592 715 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 OLIG2Q13516 323 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 ITGA9Q13797 1035 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 TFDP3Q5H9I0 405 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 KDELC1Q6UW63 502 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 FAF2Q96CS3 445 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 UCK2Q9BZX2 261 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 HAUS4Q9H6D7 363 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 GLOD4Q9HC38 313 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 PLAGL1Q9UM63 463 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 COL6A5A8TX70 2615 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 FFAR3O14843 346 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 GPR42O15529 346 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-230ENST00000551968 BMP10O95393 424 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms