RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 PARVBQ9HBI1 364 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 SNX15Q9NRS6 342 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 TLK1Q9UKI8 766 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ACOT9Q9Y305 439 aa15.96■□□□□ 0.15
PACSIN3-210ENST00000533686 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.96■□□□□ 0.15
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PACSIN3-210ENST00000533686 A0A087X1B8 175 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 BTN3A3O00478 584 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 C2P06681 752 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC166P0CW27 439 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ERGP11308 486 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 JUPP14923 745 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CCKBRP32239 447 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACSIN3-210ENST00000533686 INHBCP55103 352 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PRKAA1Q13131 559 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CYP2A13Q16696 494 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ISXQ2M1V0 245 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACSIN3-210ENST00000533686 CD180Q99467 661 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PKP4Q99569 1192 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 XKR8Q9H6D3 395 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 WASF3Q9UPY6 502 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PDE10AQ9Y233 779 aa15.95■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A096LPK6 155 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF839A8K0R7 811 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 BTN3A1O00481 513 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACSIN3-210ENST00000533686 CSO75390 466 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 MPOP05164 745 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ADRB1P08588 477 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 THRAP10827 490 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CD1DP15813 335 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST1H2ADP20671 130 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 AP1S2P56377 157 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACSIN3-210ENST00000533686 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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PACSIN3-210ENST00000533686 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CARFQ8N187 725 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC138Q96M89 665 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 NRTNQ99748 197 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ZMYND15Q9H091 742 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM9Q9P0T7 183 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.94■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC189A1A4V9 331 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PIPSLA2A3N6 862 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 C2orf74A8MZ97 194 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CDC7O00311 574 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CDH16O75309 829 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 GFERP55789 205 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CSHL1Q14406 222 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PHKG1Q16816 387 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 IRGCQ6NXR0 463 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 SBSNQ6UWP8 590 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 PRSS42Q7Z5A4 293 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 CABS1Q96KC9 395 aa15.93■□□□□ 0.14
PACSIN3-210ENST00000533686 IL17FQ96PD4 163 aa15.93■□□□□ 0.14
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