RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EDIL3	O43854	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TPPP	O94811	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	OR2C1	O95371	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ADCY5	O95622	1261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ICAM1	P05362	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PON1	P27169	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	IL17A	Q16552	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NAGS	Q8N159	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908		F5H6K3	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	LAD1	O00515	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GABRB1	P18505	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SAT1	P21673	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GNA11	P29992	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	HOXD13	P35453	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	KLRC3	Q07444	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	KCNC3	Q14003	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF234	Q14588	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TNIP1	Q15025	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	STX1A	Q16623	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GAD1	Q99259	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS13-208	ENST00000531908	EP400	Q96L91	3159 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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