RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	NR2C2	P49116	596 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PEX5	P50542	639 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GMFB	P60983	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HGFAC	Q04756	655 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MGAT2	Q10469	447 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RALGDS	Q12967	914 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	EMC2	Q15006	297 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	IQCB1	Q15051	598 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ADCK1	Q86TW2	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LGI4	Q8N135	537 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT222	Q8N1A0	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX33	Q8WV41	574 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	USP28	Q96RU2	1077 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SH3GL1	Q99961	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	COX16	Q9P0S2	106 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DEC1	Q9P2X7	70 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RYR2	Q92736	4967 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PPE2	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PR64	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PRV1	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TLR4	O00206	839 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PPEF2	O14830	753 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SCAMP1	O15126	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF202	O95125	648 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SMC2	O95347	1197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	BMP15	O95972	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	S100A6	P06703	90 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CALM1	P0DP23	149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CALM2	P0DP24	149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CALM3	P0DP25	149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKAR1A	P10644	381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KIT	P10721	976 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKCH	P24723	683 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GCH1	P30793	250 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GRK5	P34947	590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ARL2	P36404	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SYK	P43405	635 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	VPS41	P49754	854 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RRAD	P55042	308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MPP3	Q13368	585 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RIPK1	Q13546	671 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	VEPH1	Q14D04	833 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	AARD	Q4LEZ3	155 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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