RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	WHRN	Q9P202	907 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MED16	Q9Y2X0	877 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRK2	Q5S007	2527 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GSAP	A4D1B5	854 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLCD2	A6NGC4	264 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325		E7ESA3	106 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325		H3BMM5	538 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KPNA5	O15131	536 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM87A	P0C7U9	286 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GABRB3	P28472	473 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRB7	Q14451	532 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GBX1	Q14549	363 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNAB1	Q14722	419 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	STEAP4	Q687X5	459 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BBOF1	Q8ND07	529 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBXN4	Q92575	508 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC39	Q96DD0	335 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CERS2	Q96G23	380 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDA1	Q9BW61	102 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR70	Q9NW82	654 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLG2	Q9UHN1	485 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	POMT2	Q9UKY4	750 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT87P	A6NCN2	255 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325		E5RI56	91 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	GP1BB	P13224	206 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLCN7	P51798	805 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC7A5	Q01650	507 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXM1	Q08050	763 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKAA1	Q13131	559 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CBLB	Q13191	982 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KYNU	Q16719	465 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBTB2	Q8N680	514 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR6C1	Q96RD1	312 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD180	Q99467	661 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MENT	Q9BUN1	341 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPRY4	Q9C004	299 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NBAS	A2RRP1	2371 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	AHSG	P02765	367 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	LIPC	P11150	499 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOLR1	P15328	257 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDH3	P22223	829 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SHMT2	P34897	504 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	BDKRB1	P46663	353 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB15	P59190	212 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLE1	Q04724	770 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CALCOCO2	Q13137	446 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CUL1	Q13616	776 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	DTX1	Q86Y01	620 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL17F	Q96PD4	163 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDN	Q99608	321 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR21	Q99679	349 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		15.33	■□□□□ 0.04

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