RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 PIPSLA2A3N6 862 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 A8MU76 341 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C2orf74A8MZ97 194 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 B4E171 279 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BTN3A3O00478 584 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RASGRF2O14827 1237 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC16A5O15375 505 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NVLO15381 856 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZBTB14O43829 449 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FKBP9O95302 570 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MPOP05164 745 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ITGA2BP08514 1039 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RHOXF2BP0C7M4 288 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MSL3P1P0C860 447 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C1QTNF9P0C862 333 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ERGP11308 486 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BMP2P12643 396 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MPSTP25325 297 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TNFRSF8P28908 595 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PHBP35232 272 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HSD17B2P37059 387 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 GP5P40197 560 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TSPAN7P41732 249 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RGS4P49798 205 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RAB28P51157 221 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 GFERP55789 205 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 IL2P60568 153 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 GABREP78334 506 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MC2RQ01718 297 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 POU4F1Q01851 419 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CYP4F3Q08477 520 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PRKAA1Q13131 559 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 KIR2DS3Q14952 304 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CYP2A13Q16696 494 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PHF19Q5T6S3 580 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TTC23LQ6PF05 361 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CLEC14AQ86T13 490 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BMPERQ8N8U9 685 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 GPATCH11Q8N954 259 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CFAP61Q8NHU2 1237 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FAM136AQ96C01 138 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 VPS39Q96JC1 886 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TGM7Q96PF1 710 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OR2A14Q96R47 310 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NDNQ99608 321 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 GPR22Q99680 433 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RBBP8Q99708 897 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OLFM1Q99784 485 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HGH1Q9BTY7 390 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 POMT2Q9UKY4 750 aa5.21□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NFU1Q9UMS0 254 aa5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms