RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NUS1Q96E22 293 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TRIM15Q9C019 465 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TMEM245Q9H330 911 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NANOGQ9H9S0 305 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 C1orf109Q9NX04 203 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SNX6Q9UNH7 406 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 REV3LO60673 3130 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 C6P13671 934 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GSK3BP49841 420 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PLIN5Q00G26 463 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CATSPER1Q8NEC5 780 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SUSD6Q92537 303 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GLMNQ92990 594 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FBXL8Q96CD0 374 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DPY30Q9C005 99 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TXNDC9O14530 226 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AREL1O15033 823 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SOD1P00441 154 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SOX11P35716 441 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 HALP42357 657 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PFN3P60673 137 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GRM2Q14416 872 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SPATS1Q496A3 300 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 HOMEZQ8IX15 550 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DPP10Q8N608 796 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GATA6Q92908 595 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PBX4Q9BYU1 374 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DZANK1Q9NVP4 752 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 OBP2AQ9NY56 170 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NPPAP01160 153 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PDHA2P29803 388 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GPR1P46091 355 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MED21Q13503 144 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GPR149Q86SP6 731 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 HID1Q8IV36 788 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PPM1MQ96MI6 270 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 OR2AG1Q9H205 316 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.3■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CEP290O15078 2479 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ARNTLO00327 626 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CLGNO14967 610 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 ARPC2O15144 300 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PRAMEF4O60810 478 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 EPHX1P07099 455 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 OPRD1P41143 372 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 IL12RB1P42701 662 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 BDKRB1P46663 353 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CHIT1Q13231 466 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 RUNX3Q13761 415 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CPA6Q8N4T0 437 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MED8Q96G25 268 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 PIF1Q9H611 641 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 EPOPA6NHQ4 379 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 AQP12BA6NM10 295 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 CATP04040 527 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 BCKDHAP12694 445 aa16.29■□□□□ 0.2
TOM1-216ENST00000492723 GJA4P35212 333 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms