RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 E7EQ34 232 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PTGIRP43119 386 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 FOXK1P85037 733 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 KLRB1Q12918 225 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 CHAF1BQ13112 559 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB110Q30KQ9 67 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf22Q6V702 233 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 PRELID2Q8N945 189 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 ASZ1Q8WWH4 475 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 IL22Q9GZX6 179 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB3-211ENST00000490677 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CXCR5P32302 372 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 BASP1P80723 227 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 IGFBP7Q16270 282 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 SLC5A12Q1EHB4 618 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 ASB18Q6ZVZ8 466 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 FAM20CQ8IXL6 584 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC22Q8N4W6 341 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM58Q8NG06 486 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 KIFC1Q9BW19 673 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 SYBUQ9NX95 663 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 SHANK1Q9Y566 2161 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TPSB2P20231 275 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 GCGRP47871 477 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 NPY2RP49146 381 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TTPAP49638 278 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 RAB28P51157 221 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 KIR2DS3Q14952 304 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 NCF4Q15080 339 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TPSAB1Q15661 275 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MAIP1Q8WWC4 291 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MFSD3Q96ES6 412 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 SNX7Q9UNH6 387 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 ARGFXA6NJG6 315 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 F8W8V4 182 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K7O43318 606 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CBSLP0DN79 551 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MGAT1P26572 445 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CBSP35520 551 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 RHBDD2Q6NTF9 364 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC8BQ6P9F7 803 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 UNC5DQ6UXZ4 953 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 ING2Q9H160 280 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CIDEBQ9UHD4 219 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 DOCK10Q96BY6 2186 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 ISM1B1AKI9 464 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CEP104O60308 925 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CEACAM4O75871 244 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 OR2B3O76000 313 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEA6P43360 314 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ11Q14654 390 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CTSL3PQ5NE16 218 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CES3Q6UWW8 571 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MPP5Q8N3R9 675 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB2Q8N680 514 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 BIRC8Q96P09 236 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 IL17FQ96PD4 163 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 GBP5Q96PP8 586 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 BFARQ9NZS9 450 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 ANAPC5Q9UJX4 755 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL20Q9Y2M5 609 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 APOA4P06727 396 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 HBQ1P09105 142 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CD9P21926 228 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CDK16Q00536 496 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TTC27Q6P3X3 843 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 GSTA5Q7RTV2 222 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 HOOK3Q86VS8 718 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM151BQ8IW70 566 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 GPR135Q8IZ08 494 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TSSK1BQ9BXA7 367 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 SOX13Q9UN79 622 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 LRRK2Q5S007 2527 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 MAGP20916 626 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TYSND1Q2T9J0 566 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 OR2L8Q8NGY9 312 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CFAP61Q8NHU2 1237 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 GNPTGQ9UJJ9 305 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms